來源:新華網(wǎng)
2017-11-13 14:17:11
多國科學(xué)家日前在美國《國家科學(xué)院學(xué)報(bào)》上發(fā)表報(bào)告說,他們運(yùn)用計(jì)算機(jī)模型“解碼”了艾滋病病毒在細(xì)胞間傳播的未知細(xì)節(jié),有望為開發(fā)抗艾藥物找到新方法。
艾滋病病毒增殖的“訣竅”是迫使細(xì)胞在細(xì)胞膜上形成囊膜供病毒容身,囊膜脫落被稱為出芽,出芽后病毒體進(jìn)入其他細(xì)胞展開復(fù)制,阻斷這一早期過程是治療艾滋病的一種可能方法。
中國北京大學(xué)和美國芝加哥大學(xué)等機(jī)構(gòu)的研究人員建立了一個(gè)“粗粒化”計(jì)算機(jī)模型,揭示了一種名為HIV-1 Gag的蛋白質(zhì)在細(xì)胞膜上可能的構(gòu)象。這種蛋白是病毒的主要組裝蛋白,參與了出芽,但科學(xué)家一直難以運(yùn)用實(shí)驗(yàn)手段獲得分子層面上組裝過程的清晰影像。
研究人員選擇在計(jì)算機(jī)中構(gòu)造了這種蛋白的缺失部分,通過調(diào)試參數(shù)最終發(fā)現(xiàn),這種蛋白利用病毒核糖核酸和細(xì)胞膜作為“腳手架”自行組裝起來。研究人員還發(fā)現(xiàn),小核糖核酸可以抑制這種蛋白組裝。
論文作者、北京大學(xué)工學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系陳匡時(shí)在接受新華社記者采訪時(shí)說:“借助計(jì)算機(jī)模型,可以模擬顯微鏡手段無法分辨的過程,且方便調(diào)試或增減參數(shù)。”通過計(jì)算機(jī)構(gòu)建復(fù)雜的分子過程,醫(yī)生可以在實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步預(yù)測(cè)藥物效果。
論文通訊作者、芝加哥大學(xué)教授格雷戈里·沃斯在一份聲明中說:“一旦抓住Gag蛋白組裝過程的弱點(diǎn),就有望阻斷病毒增殖。這展示了現(xiàn)代計(jì)算機(jī)模擬的力量。”
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