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華大基因:火眼辨陰陽

來源:中國婦女報

作者:

2020-03-30 08:41:03

檢測樣本

□中國婦女報·中國婦女網(wǎng)

武漢戰(zhàn)疫報道組

最忙碌的疫情“前哨”,依然保持戰(zhàn)時節(jié)奏。

在武漢光谷城核心區(qū),一幢尚未正式啟用的辦公樓里,當(dāng)每份樣本被送入一層的2000平方米空間里開始流轉(zhuǎn),就意味著最多8小時內(nèi)就能測定,送檢者是否已面臨新冠病毒的侵襲。

運行近50天來,這樣的樣本測定,武漢火眼實驗室已完成23萬多份。

“作為一個可以每日完成2萬人份檢測的機構(gòu),武漢火眼實驗室的檢測能力一直位于疫情發(fā)展速度之上。”華大武漢前線指揮部負責(zé)人朱師達說。

從2月16日至今,火眼的日檢測量,就再也沒低于湖北每日新增確診病例。

即使湖北新增確診病例和疑似病例逐漸進入“雙清零”,火眼“依然清醒”,日檢測量始終保持在2000人份以上。

動力,來自一支由300多名華大基因科研人員組成的“檢測戰(zhàn)隊”,他們依然保持著“7×24”的工作節(jié)奏。

實驗室的每一個結(jié)果,對送檢者而言,此前意味著能否“有一張病床”,現(xiàn)在更成為能否“告別病房”的重要依據(jù)。

3月22日,在火眼實驗室入口處,數(shù)據(jù)每日更新的大屏幕前,朱師達慢條斯理地講述著,這一個個數(shù)據(jù)背后,一家民營科研企業(yè)如何用17年沉淀,“讓基因技術(shù)成為與新冠病毒對決的重要武器”。

技術(shù)積累決定實力

問:為什么華大可以在短時間內(nèi)完成對新冠病毒的基因序列測定?

答:早在2003年,華大基因已完成人類基因組計劃精細圖。與擁有多達30億對堿基的人類基因相比,新冠病毒只有3萬堿基左右,對華大來說,破譯新冠基因密碼自然不在話下。此后基于這些序列進而研發(fā)、量產(chǎn)核酸檢測試劑盒和測序試劑盒,也是順理成章的。華大有絕對的技術(shù)實力。

問:核酸檢測大家都已了解。通俗地說,測序就是讓我們知道這個病毒長什么樣?

答:在一開始,測序承擔(dān)的是這樣的作用。作為一個新的病毒,需要把它整個的基因組組裝出來,才能夠知道它跟其他冠狀病毒的異和同。同的部分就是要認(rèn)知它的來源,可能的中間宿主等等,異的部分就是要特異性去開發(fā)檢測的試劑盒。

問:到現(xiàn)在為止,華大依然是唯一同時擁有測序試劑和核酸試劑生產(chǎn)能力的企業(yè)?

答:對。作為臨床診斷來講,核酸檢測是一個更大規(guī)模低成本的方法。測序不會大規(guī)模大批量地用于臨床診斷,但是它在溯源、監(jiān)測病毒變化的過程中,發(fā)揮了比較大的作用。大家看到的研究報道,科研上的進展,其實都是基于測序技術(shù)。測序結(jié)果能夠讓我們更清楚地了解病毒的情況,發(fā)現(xiàn)和解答很多我們現(xiàn)在尚不知道的問題。比如,病毒從哪里來?怎樣侵犯細胞?怎么發(fā)揮作用?以及病毒是如何變化的?這種變化會產(chǎn)生什么影響等等。

問:兩種試劑盒同時應(yīng)用,對華大來說是件挺難的事嗎?

答:不是。一是基于技術(shù)的積累,二是平臺的能力。所謂平臺,就是測序里面一個關(guān)鍵的設(shè)備叫測序儀,華大是國內(nèi)唯一能夠量產(chǎn)臨床應(yīng)用測序儀的企業(yè),在國際上也是唯二的。

問:實現(xiàn)試劑盒保障供應(yīng)后,為什么很快就開始著手火眼實驗室的建設(shè)?

答:華大創(chuàng)始人汪建老師在到武漢的第一天就明確表示,傳染病防控是檢測大于隔離,隔離大于治療。這種前瞻性也是基于他曾帶領(lǐng)團隊參與抗擊非典。這也讓我們都意識到,對于規(guī)模檢驗,一開始最大的瓶頸不是試劑盒,而是檢測能力。那段時間,面對“積壓病例很多,疑似病例數(shù)下不來,大量的病人需要有檢測結(jié)果才能確診并入院”的現(xiàn)狀,讓我們更加確定,只有試劑盒是遠遠不夠的,還需要通過高生物安全等級的實驗室大規(guī)模完成檢測流程。

問:2月5日剛剛啟動時,火眼的日檢測通量是1萬例,3月1日就實現(xiàn)翻倍至2萬例。25天時間實現(xiàn)迅速提升,是在當(dāng)初設(shè)計火眼時就準(zhǔn)備好的嗎?

答:一開始的設(shè)計通量是每天1萬例。在整個2月份,檢測能力都高于實際檢測量的,這與“床等人”是一個意思。我們的檢測能力,一定要比我們的需求要高。從數(shù)據(jù)變化也可以看到,從2月中旬提出應(yīng)檢盡檢、日清日結(jié)等要求以來,檢測數(shù)量在四五千到六七千之間。

到2月底的時候,基于對特殊人群檢測的需求,量一下子上來了。其實在2月20日左右,我們已經(jīng)在考慮繼續(xù)提升檢測能力。因為應(yīng)檢盡檢的實現(xiàn),疫情已基本得到控制,我們的判斷是,社會復(fù)工復(fù)產(chǎn)會帶來更大的需求,我們就計劃把通量進一步提升,但進一步提升需要一個過程。

在3月1日就提升到2萬的日檢測通量。這是在我們計劃中的,但比我們的計劃更早實現(xiàn)。在檢測需求快速提升的情況下,不管是在設(shè)備物流上面,還是在人員調(diào)撥上面,時間極限壓縮,第二天就實現(xiàn)了2萬通量,現(xiàn)在都是保持這樣的一個能力。果然到了3月5日,檢測量超過了1.6萬。

其實火眼的能力還是有富余。日清日結(jié)、應(yīng)檢盡檢、24小時交付,都是我們的承諾,一定要做到。

問:華大是一家民營商業(yè)機構(gòu),但在疫情期間并沒體現(xiàn)這一特性。

答:汪建老師帶領(lǐng)的華大,一直都很具有社會責(zé)任感。非典的時候就捐了30萬人份試劑盒。這次,截至3月22日,華大基因共計向全國捐贈134050人份新型冠狀病毒核酸檢測試劑盒,并已全部發(fā)放到位。第三方愛心機構(gòu)通過向華大基因公益采購對全國各地捐贈試劑盒共計178600人份。此外,華大還聯(lián)合猛犸基金會等慈善組織,對日本、秘魯、安哥拉、菲律賓、塞爾維亞、文萊、阿根廷、貝寧等國捐贈新冠病毒核酸檢測試劑盒。

我們現(xiàn)在想的,就是通過所能所學(xué)所為,更好地為社會發(fā)揮作用,在這個過程里,商業(yè)利益、經(jīng)濟訴求不是最重要的。當(dāng)然,也需要有實力和能力來做這件事。

火眼應(yīng)成為基礎(chǔ)設(shè)施

問:現(xiàn)在檢測樣本送到火眼,多久可以出結(jié)果?

答:六七個小時就可以。但是,規(guī)模化檢測有先來后到。按照要求是24小時之內(nèi)要出結(jié)果,這個可以保證做到。其實大家容易產(chǎn)生一個誤區(qū),比如,PCR實驗一般來說,2~3個小時就可以做完,很多人就不理解,為什么檢測結(jié)果要隔天才能拿到?原因在于,第一,新冠病毒的核酸檢測的過程,不只是單純的PCR實驗而已,它還包括滅活、取樣分裝、核酸提取等,整個實驗流程,再到發(fā)放報告,平均是在六七個小時左右。第二,是規(guī)模化通量的問題,舉個例子,去火車站買票,一個人買票半分鐘,但是1萬個人買票,只開一個窗口的話,那就要排三四天,所以要增加窗口,同時讓每個窗口更高效。這就是規(guī)模化自動化的作用。一些小型實驗室對于600個樣本的檢測就需要做一天。但是我們一個批次就可以做完,24小時不停去做,最終確保具有日檢測2萬人份的能力。

這也是為什么,只有火眼實驗室這樣的模式,可以在疫情期間承擔(dān)大通量的檢測任務(wù)。

問:疫情結(jié)束之后,火眼還有繼續(xù)存在的價值嗎?

答:火眼實驗室不會是一時的。基于這樣的模式,華大基因已經(jīng)在武漢、深圳、北京、上海、天津、長沙、石家莊、重慶(技術(shù)支持)、無錫(技術(shù)支持)等9地布局火眼實驗室并承接樣本檢測工作。另外,青島、貴陽、昆明等地的火眼實驗室正在籌建中。能夠共同承擔(dān)起人群排查等更多疫情防控任務(wù),為全國復(fù)工復(fù)產(chǎn)提供科學(xué)支撐。

在我的理解里,火眼實驗室是一項基礎(chǔ)設(shè)施,應(yīng)該與疾控體系一起組成立體的公共衛(wèi)生防控體系,成為“國家隊”的一部分。同時,經(jīng)過驗證確實有效的火眼模式還可以在海外復(fù)制,為國際社會防控疫情發(fā)揮作用。

核酸檢測的確定性最高

問:核酸檢測的準(zhǔn)確性還是在一段時間受到了質(zhì)疑,大家會覺得CT、血檢更準(zhǔn)確些。

答:我們還是要堅持科學(xué)——是不是病毒感染,一定要找到病毒的證據(jù)。

有一段時間核酸檢測爭議比較大,主要有幾個原因。第一是采樣是否到位或合格。因為檢測只對樣本負責(zé),樣本里面有病毒,就一定可以檢測出來。第二是病程的影響。在疾病發(fā)病的過程里,從下呼吸道到上呼吸道再到咽喉、鼻腔,病毒的載量是不一樣的。采樣的規(guī)范性和病程都會影響到樣本里有沒有病毒。在第7版的診療指南里,出院標(biāo)準(zhǔn)增加了肛拭子,這就是一個更加嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)。第三是試劑盒的質(zhì)量和靈敏度。不同的研發(fā)工藝,也一定程度會影響試劑盒的表現(xiàn)。

另外,血檢就是檢測血液里的抗體,一個是IgM,一個是IgG。IgM是非特異性的抗體,在感染的最初幾天會出現(xiàn),但是再過幾天就下去了,IgG是一個長期的抗體,但可能要到一周之后才會出現(xiàn),所以也不適合做篩查和診斷,現(xiàn)在已經(jīng)獲批的IgM和IgG的試劑盒,適用范圍還是輔助診斷。

目前,核酸檢測還是確定性最高的,但需要在樣本質(zhì)控方面做得更好。

(記者:王長路劉麗君徐旭)

[責(zé)任編輯:楊凡、武云泉]

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