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源代碼里的新冠疫苗和莎士比亞詩集

來源:中國新聞周刊

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2021-04-26 09:54:04

原標(biāo)題:源代碼里的新冠疫苗和莎士比亞詩集

來源:中國新聞周刊

文/張?zhí)锟?/p>

在新冠疫苗大戰(zhàn)中脫穎而出的mRNA疫苗技術(shù),是通過破譯和利用新冠病毒的生命密碼來制造疫苗,而病毒的生命密碼與計算機軟件的源代碼相類似。只不過,生物基因組中的生命源代碼是天然的,并在演化過程中產(chǎn)生和不斷改進,而計算機的密碼是人類設(shè)計的。

輝瑞/BioNTech的BNT162b2疫苗設(shè)計是糅合了生命密碼和計算機源代碼的原理而研發(fā)成功的。BNT162b mRNA疫苗內(nèi)部的數(shù)字代碼長度為4284個字符。在疫苗設(shè)計時,將這些代碼上傳到DNA打印機,然后將磁盤上的字節(jié)轉(zhuǎn)換為實際的DNA分子。這個過程叫逆轉(zhuǎn)錄。

生命的密碼,也即遺傳密碼或生命的源代碼,是由幾個基本的堿基進行配對而形成的。生命源代碼與計算機源代碼的相似性在于,前者是用4個堿基編碼,而后者是用由0和1組成的二進制代碼存儲和傳輸信息。在計算機中,8比特為一字節(jié),生命密碼則是把3個核苷酸編為一個密碼子,包含6個比特的信息。

當(dāng)DNA打印機根據(jù)病毒mRNA的4284個字符打印出少量的分子后,再經(jīng)過一系列生物和化學(xué)處理,外部用一個脂質(zhì)包裝系統(tǒng)包裝,這種分子就轉(zhuǎn)變?yōu)閙RNA疫苗,可以把mRNA導(dǎo)入人體免疫細胞。輝瑞的這種疫苗每劑為30微克,即包含30微克的RNA。

自然界的生命系統(tǒng)都在適應(yīng)地球環(huán)境的演化中形成了獨特而又相似的生命密碼,如果了解和破譯這些密碼,將為人類創(chuàng)造一個無限美好的未來。抗新冠病毒mRNA疫苗的產(chǎn)生,便是其中一個最新的例子。

在沒有mRNA疫苗之前,人類研發(fā)一種新疫苗和新藥物不僅耗時較長(平均約10年),而且成本高(平均約15億美元)。其原因在于,人類沒有能力破譯病原體的生命密碼。現(xiàn)在,破譯了新冠病毒的RNA密碼后,僅用一年時間,就研發(fā)出了高效、安全的新冠病毒疫苗。單以時間為比例計算,可以節(jié)約13億美元左右。

不僅如此,依靠破譯和模仿生命密碼而研發(fā)出mRNA疫苗的幾家公司將獲得巨額利潤。2021年1月,研究公司Finaria表示,輝瑞/BioNTech和莫德拉將在2021年新冠疫苗銷售中占據(jù)最大份額,并在未來三年內(nèi)共實現(xiàn)147億美元的收入。

這種情況也讓人看不懂:既然輝瑞公司已經(jīng)公開了新冠病毒的基因組,就像UNIX公開其源代碼一樣,他們還能利用專利和藥物銷售賺到錢嗎?

這里涉及基因研究的一個長期爭論——基因是否有專利?經(jīng)過多年的探討,基因?qū)@纬闪艘恍┕沧R。今天,重組基因技術(shù)及其專利的保護,成為和基因相關(guān)的制藥產(chǎn)業(yè)迅速發(fā)展的基礎(chǔ),不僅可以讓生命和萬物源代碼傳播到世界各國,而且刺激了大量投資,用于新生物制品的研究開發(fā)和商業(yè)化。mRNA新冠疫苗的研發(fā)成功,就是源代碼開放和專利保護結(jié)合的典范。

福樓拜說,科學(xué)與藝術(shù)在山麓下分手,在山頂上匯合。然而,即便不到“山頂”,自然和人文也可以結(jié)合,而且自然與人類的創(chuàng)作可以相融——核酸不僅僅用于研發(fā)疫苗,還可以取代計算機,成為下一代信息技術(shù)的載體,DNA圖書就是其中一例。

人類的圖書經(jīng)歷了石頭書、龜甲書、竹簡書、布書(養(yǎng)蠶業(yè)與織布提供了布料)、紙書(蔡倫發(fā)明紙之后)和數(shù)字圖書的歷程。而全新的圖書——DNA(脫氧核糖核酸)圖書已經(jīng)進入我們的生活。

DNA圖書也采用計算機技術(shù)與生物技術(shù)結(jié)合,用計算機的二進制數(shù)字“0”和“1”與基因的4種堿基進行轉(zhuǎn)化編碼、編程,把數(shù)字圖書所編碼的所有文字、圖像、符號等再編碼進DNA中,制作成DNA圖書。在閱讀時,再利用DNA測序技術(shù)把DNA密碼還原為數(shù)字編碼,就可以解碼和閱讀。

DNA圖書最吸引人的還是它與傳統(tǒng)圖書和數(shù)字圖書相比的巨大優(yōu)勢。它的蘊藏量是無限的,其體積更小,遠比光盤、U盤、硬盤更小,而且信息可以長久地保存于DNA中。根據(jù)DNA的半衰期,如果在-5℃的最理想條件下保存,DNA的4個堿基可以保存680萬年。這就意味著,制成的DNA圖書可以保存上百萬年。

早在2012年9月28日,《科學(xué)》雜志就發(fā)表了哈佛大學(xué)維斯生物工程研究所的喬治·丘奇等人的文章。他們成功地編碼出一本5.27兆比特的DNA圖書,書名叫做《再生》。這本書有5.34萬個單詞,還有11張JPG格式的圖片和一段Java Script程序。

2013年,另一本DNA圖書《莎士比亞詩集》也誕生了,由歐洲生物信息研究所的尼克·戈爾德曼等人編撰而成。該書編入的內(nèi)容有莎士比亞全部154首十四行詩、一篇沃森和克里克DNA雙螺旋論文的副本(沃森和克里克因此而獲諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎)、一張戈爾德曼等人所在研究機構(gòu)大樓的彩色照片、一段這次試驗使用的軟件算法,還有一段長達26秒來自馬丁·路德·金著名演講《我有一個夢》的剪輯音頻。信息總量約739千字節(jié)。

當(dāng)數(shù)字內(nèi)容編寫進DNA后,再用專門的設(shè)備合成為DNA《莎士比亞詩集》。在讀取或閱讀DNA《莎士比亞詩集》時,先把合成的DNA《莎士比亞詩集》放入標(biāo)準(zhǔn)化學(xué)試劑,然后再用DNA測序儀根據(jù)索引標(biāo)識,將各個DNA片段依順序粘貼成原來的DNA序列,再轉(zhuǎn)譯到數(shù)字文件的二進制碼,從而形成電子文件,就可閱讀了。

生物技術(shù)與信息技術(shù)相結(jié)合,將有我們想象不到的發(fā)展前景,并將為人類的未來帶來無限的可能。

《中國新聞周刊》2021年第15期

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[責(zé)任編輯:楊凡、崔中連]

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