來源:工人日報
2019-12-13 06:35:12
本報訊(記者黃哲雯)近日,《自然-遺傳學(xué)》以兩篇長文形式在線發(fā)表了兩項由中國農(nóng)科院領(lǐng)銜開展的瓜類作物基因組研究成果。兩項研究分別構(gòu)建了甜瓜和西瓜的全基因組變異圖譜,揭示了兩種水果的馴化歷史及果實品質(zhì)的遺傳分子機制。上述成果的發(fā)表,將進一步強化我國在瓜類作物基因組學(xué)與分子育種領(lǐng)域的國際領(lǐng)先地位。
據(jù)介紹,中國農(nóng)科院鄭州果樹研究所徐永陽研究團隊聯(lián)合中國農(nóng)科院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所、西班牙巴塞羅那基因組中心及中國農(nóng)科院蔬菜花卉研究所、青島農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、美國康奈爾大學(xué)、法國農(nóng)業(yè)科學(xué)院等19個國內(nèi)外科研機構(gòu),歷時5年共同構(gòu)建了世界第一個甜瓜全基因組變異圖譜,首次系統(tǒng)闡釋了甜瓜的復(fù)雜馴化歷史及重要農(nóng)藝性狀形成的遺傳基礎(chǔ)。
甜瓜研究團隊分析了千余份甜瓜種質(zhì)資源的基因組變異,共鑒定了560萬個SNP。在此基礎(chǔ)上,發(fā)現(xiàn)甜瓜可能發(fā)生過三次獨立的馴化事件,其中一次發(fā)生在非洲地區(qū),另外兩次發(fā)生在亞洲地區(qū)并分別產(chǎn)生了厚皮甜瓜和薄皮甜瓜兩個栽培亞種。三次獨立馴化“異曲同工”,都導(dǎo)致野生甜瓜失去苦味和酸味并獲得了甜味。此外,通過全基因組關(guān)聯(lián)分析等手段,定位了200余個與甜瓜苦味、酸味、果實大小、果肉顏色等性狀相關(guān)的候選基因和位點。
另外,中國農(nóng)科院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所黃三文研究團隊協(xié)同鄭州果樹研究所、北京市農(nóng)林科學(xué)院、美國康奈爾大學(xué)組成聯(lián)合攻關(guān)團隊,采用單分子測序、光學(xué)圖譜與Hi-C三維基因組聯(lián)合分析,完成了高質(zhì)量的西瓜基因組序列圖譜,繼而對400多份種質(zhì)資源開展了基因組變異分析,共鑒定近2000萬個SNP。此外,鑒定獲得了與果實含糖量、瓤色、形狀等性狀關(guān)聯(lián)的43個信號位點,提供了關(guān)鍵候選基因。
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